Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOA1P02647 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
APOA1P02647 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA1P02647 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA1P02647 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms