Protein–RNA interactions for Protein: O96015

DNAL4, Dynein light chain 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAL4O96015 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
DNAL4O96015 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms