Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZBED1O96006 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZBED1O96006 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms