Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SKAP2O75563 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SKAP2O75563 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms