Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PPFIA4O75335 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PPFIA4O75335 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms