Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB11FIP3O75154 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RAB11FIP3O75154 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms