Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PPFIA3O75145 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PPFIA3O75145 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms