Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGSF3O75054 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGSF3O75054 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms