Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAK2O60296 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRAK2O60296 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms