Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN1O60240 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN1O60240 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLIN1O60240 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PLIN1O60240 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PLIN1O60240 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLIN1O60240 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms