Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6DO43924 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PDE6DO43924 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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