Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CTIFO43310 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTIFO43310 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTIFO43310 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTIFO43310 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CTIFO43310 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CTIFO43310 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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