Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCP110O43303 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCP110O43303 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCP110O43303 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCP110O43303 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCP110O43303 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCP110O43303 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCP110O43303 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCP110O43303 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCP110O43303 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms