Protein–RNA interactions for Protein: O14530

TXNDC9, Thioredoxin domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC9O14530 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TXNDC9O14530 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms