Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PODXLO00592 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PODXLO00592 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PODXLO00592 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PODXLO00592 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PODXLO00592 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms