Protein–RNA interactions for Protein: O00591

GABRP, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit pi, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRPO00591 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRPO00591 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRPO00591 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GABRPO00591 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GABRPO00591 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GABRPO00591 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GABRPO00591 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRPO00591 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRPO00591 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRPO00591 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GABRPO00591 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms