Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GOLIM4O00461 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GOLIM4O00461 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms