Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
J3QKU1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
J3QKU1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
J3QKU1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
J3QKU1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
J3QKU1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
J3QKU1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
J3QKU1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms