Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC01387J3KSC0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms