Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
J3KR12 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
J3KR12 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
J3KR12 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
J3KR12 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
J3KR12 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
J3KR12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms