Protein–RNA interactions for Protein: I3L0D1

RBAK-RBAKDN, HCG1647537, isoform CRA_b, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RBAK-RBAKDNI3L0D1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms