Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
MCRIP1C9JLW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MCRIP1C9JLW8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms