Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C4orf47A7E2U8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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C4orf47A7E2U8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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C4orf47A7E2U8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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C4orf47A7E2U8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4orf47A7E2U8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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C4orf47A7E2U8 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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