Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC0

FAM90A7P, Putative protein FAM90A7P, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM90A7PA6NKC0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM90A7PA6NKC0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms