Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SERINC4A6NH21 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SERINC4A6NH21 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms