Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms