Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USH1CQ9Y6N9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USH1CQ9Y6N9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USH1CQ9Y6N9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USH1CQ9Y6N9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USH1CQ9Y6N9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USH1CQ9Y6N9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms