Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ARFGEF1Q9Y6D6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARFGEF1Q9Y6D6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms