Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C2

EMILIN1, EMILIN-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,016 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN1Q9Y6C2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
EMILIN1Q9Y6C2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
EMILIN1Q9Y6C2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms