Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED7Q9Y3B3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED7Q9Y3B3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms