Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L6

FRMD4B, FERM domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4BQ9Y2L6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FRMD4BQ9Y2L6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FRMD4BQ9Y2L6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms