Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EFR3BQ9Y2G0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EFR3BQ9Y2G0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms