Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NOD1Q9Y239 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NOD1Q9Y239 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms