Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTNND2Q9UQB3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CTNND2Q9UQB3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms