Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SAMD4AQ9UPU9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SAMD4AQ9UPU9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms