Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SETD1BQ9UPS6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SETD1BQ9UPS6 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms