Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PHF8Q9UPP1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PHF8Q9UPP1 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHF8Q9UPP1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms