Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHA12Q9UN75 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHA12Q9UN75 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms