Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN74

PCDHA4, Protocadherin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA4Q9UN74 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PCDHA4Q9UN74 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PCDHA4Q9UN74 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms