Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN42

ATP1B4, Protein ATP1B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B4Q9UN42 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
ATP1B4Q9UN42 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ATP1B4Q9UN42 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms