Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPO2Q9UMS6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPO2Q9UMS6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYNPO2Q9UMS6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SYNPO2Q9UMS6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYNPO2Q9UMS6 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms