Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NRXN1Q9ULB1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NRXN1Q9ULB1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms