Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PNMA3Q9UL41 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PNMA3Q9UL41 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms