Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRNDQ9UKY0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRNDQ9UKY0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms