Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC9Q9UKV0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC9Q9UKV0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms