Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MRTO4Q9UKD2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MRTO4Q9UKD2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms