Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TUBE1Q9UJT0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBE1Q9UJT0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms