Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TMEFF2Q9UIK5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TMEFF2Q9UIK5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms