Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX25Q9UHL0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DDX25Q9UHL0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms