Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
MLH3Q9UHC1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
MLH3Q9UHC1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MLH3Q9UHC1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms